学校建有基础、护理、口腔、药学、影像、临床6个实验中心，共有解剖、微免、生物、化学、物理等219个实验室，生物医学工程技术实验室是山东省教育厅批准建设的“十二五”高校重点实验室。
齐鲁医药学院生物医学工程技术实验室是在学校药学系实验中心的基础上建设的，于2011年7月由山东省教育厅批准建设“十二五”高校生物医学工程技术重点实验室。实验室现有专兼职教师22人，其中教授4人，副教授5人，讲师13人，博士4人，硕士13人，涵盖生物制药、生物学、药物制剂、生物传感技术、生物化学等多个领域。实验室在发展过程中逐步形成了三个研究方向：（1）药物制剂及传递技术；（2）分子生物学及生物传感技术；（3）生物医学材料及生物制药技术。目前，实验室已完成多项教科研课题，现承担省部级课题10项，院级课题7项，17篇论文被SCI收录，多次获得省部级研究成果。
齐鲁医药学院基础医学形态学实验教学中心创建于2002年01月，隶属于基础医学教学部，根据我校实际情况，构建了基础医学形态学实验教学平台，对原基础医学所属比较分散的实验室进行了优化和重组，打破了学科界线，实现了教学资源的最大共享，本实验教学平台（整合系统解剖学、局部解剖学、断层解剖学、病原生物学、组织胚胎学、病理学、寄生虫学、细胞生物学、遗传学、血液学检验实验）；通过整合逐渐减少基础验证型实验，逐步增加综合型和设计型实验，经过近10年的建设与发展，达到了优化组合、资源共享，集教学科研于一体的实验教学中心，已经成为我院医学专业和科研的实验基地。
